Similarity of
2kpd-m10_A_U_1_G_2 2kpd-m1_A_U_1_G_2 2kpd-m2_A_U_1_G_2 2kpd-m3_A_U_1_G_2 2kpd-m4_A_U_1_G_2 2kpd-m5_A_U_1_G_2 2kpd-m6_A_U_1_G_2 2kpd-m7_A_U_1_G_2 2kpd-m8_A_U_1_G_2 2kpd-m9_A_U_1_G_2 2kpd-m10_A_G_2_A_3 2kpd-m1_A_G_2_A_3 2kpd-m2_A_G_2_A_3 2kpd-m3_A_G_2_A_3 2kpd-m4_A_G_2_A_3 2kpd-m5_A_G_2_A_3 2kpd-m6_A_G_2_A_3 2kpd-m7_A_G_2_A_3 2kpd-m8_A_G_2_A_3 2kpd-m9_A_G_2_A_3 2kpd-m10_A_A_3_G_4 2kpd-m1_A_A_3_G_4 2kpd-m2_A_A_3_G_4 2kpd-m3_A_A_3_G_4 2kpd-m4_A_A_3_G_4 2kpd-m5_A_A_3_G_4 2kpd-m6_A_A_3_G_4 2kpd-m7_A_A_3_G_4 2kpd-m8_A_A_3_G_4 2kpd-m9_A_A_3_G_4 2kpd-m10_A_G_4_C_5 2kpd-m1_A_G_4_C_5 2kpd-m2_A_G_4_C_5 2kpd-m3_A_G_4_C_5 2kpd-m4_A_G_4_C_5 2kpd-m5_A_G_4_C_5 2kpd-m6_A_G_4_C_5 2kpd-m7_A_G_4_C_5 2kpd-m8_A_G_4_C_5 2kpd-m9_A_G_4_C_5 2kpd-m10_A_C_5_U_6 2kpd-m1_A_C_5_U_6 2kpd-m2_A_C_5_U_6 2kpd-m3_A_C_5_U_6 2kpd-m4_A_C_5_U_6 2kpd-m5_A_C_5_U_6 2kpd-m6_A_C_5_U_6 2kpd-m7_A_C_5_U_6 2kpd-m8_A_C_5_U_6 2kpd-m9_A_C_5_U_6 2kpd-m10_A_U_6_C_7 2kpd-m1_A_U_6_C_7 2kpd-m2_A_U_6_C_7 2kpd-m3_A_U_6_C_7 2kpd-m4_A_U_6_C_7 2kpd-m5_A_U_6_C_7 2kpd-m6_A_U_6_C_7 2kpd-m7_A_U_6_C_7 2kpd-m8_A_U_6_C_7 2kpd-m9_A_U_6_C_7 2kpd-m10_A_C_7_A_8 2kpd-m1_A_C_7_A_8 2kpd-m2_A_C_7_A_8 2kpd-m3_A_C_7_A_8 2kpd-m4_A_C_7_A_8 2kpd-m5_A_C_7_A_8 2kpd-m6_A_C_7_A_8 2kpd-m7_A_C_7_A_8 2kpd-m8_A_C_7_A_8 2kpd-m9_A_C_7_A_8 2kpd-m10_A_A_8_G_9 2kpd-m1_A_A_8_G_9 2kpd-m2_A_A_8_G_9 2kpd-m3_A_A_8_G_9 2kpd-m4_A_A_8_G_9 2kpd-m5_A_A_8_G_9 2kpd-m6_A_A_8_G_9 2kpd-m7_A_A_8_G_9 2kpd-m8_A_A_8_G_9 2kpd-m9_A_A_8_G_9 2kpd-m10_A_G_9_U_10 2kpd-m1_A_G_9_U_10 2kpd-m2_A_G_9_U_10 2kpd-m3_A_G_9_U_10 2kpd-m4_A_G_9_U_10 2kpd-m5_A_G_9_U_10 2kpd-m6_A_G_9_U_10 2kpd-m7_A_G_9_U_10 2kpd-m8_A_G_9_U_10 2kpd-m9_A_G_9_U_10 2kpd-m10_A_U_10_U_11 2kpd-m1_A_U_10_U_11 2kpd-m2_A_U_10_U_11 2kpd-m3_A_U_10_U_11 2kpd-m4_A_U_10_U_11 2kpd-m5_A_U_10_U_11 2kpd-m6_A_U_10_U_11 2kpd-m7_A_U_10_U_11 2kpd-m8_A_U_10_U_11 2kpd-m9_A_U_10_U_11 2kpd-m10_A_U_11_U_12 2kpd-m1_A_U_11_U_12 2kpd-m2_A_U_11_U_12 2kpd-m3_A_U_11_U_12 2kpd-m4_A_U_11_U_12 2kpd-m5_A_U_11_U_12 2kpd-m6_A_U_11_U_12 2kpd-m7_A_U_11_U_12 2kpd-m8_A_U_11_U_12 2kpd-m9_A_U_11_U_12 2kpd-m10_A_U_12_G_13 2kpd-m1_A_U_12_G_13 2kpd-m2_A_U_12_G_13 2kpd-m3_A_U_12_G_13 2kpd-m4_A_U_12_G_13 2kpd-m5_A_U_12_G_13 2kpd-m6_A_U_12_G_13 2kpd-m7_A_U_12_G_13 2kpd-m8_A_U_12_G_13 2kpd-m9_A_U_12_G_13 2kpd-m10_A_G_13_C_14 2kpd-m1_A_G_13_C_14 2kpd-m2_A_G_13_C_14 2kpd-m3_A_G_13_C_14 2kpd-m4_A_G_13_C_14 2kpd-m5_A_G_13_C_14 2kpd-m6_A_G_13_C_14 2kpd-m7_A_G_13_C_14 2kpd-m8_A_G_13_C_14 2kpd-m9_A_G_13_C_14 2kpd-m10_A_C_14_U_15 2kpd-m1_A_C_14_U_15 2kpd-m2_A_C_14_U_15 2kpd-m3_A_C_14_U_15 2kpd-m4_A_C_14_U_15 2kpd-m5_A_C_14_U_15 2kpd-m6_A_C_14_U_15 2kpd-m7_A_C_14_U_15 2kpd-m8_A_C_14_U_15 2kpd-m9_A_C_14_U_15 2kpd-m10_A_U_15_C_16 2kpd-m1_A_U_15_C_16 2kpd-m2_A_U_15_C_16 2kpd-m3_A_U_15_C_16 2kpd-m4_A_U_15_C_16 2kpd-m5_A_U_15_C_16 2kpd-m6_A_U_15_C_16 2kpd-m7_A_U_15_C_16 2kpd-m8_A_U_15_C_16 2kpd-m9_A_U_15_C_16 2kpd-m10_A_C_16_A_17 2kpd-m1_A_C_16_A_17 2kpd-m2_A_C_16_A_17 2kpd-m3_A_C_16_A_17 2kpd-m4_A_C_16_A_17 2kpd-m5_A_C_16_A_17 2kpd-m6_A_C_16_A_17 2kpd-m7_A_C_16_A_17 2kpd-m8_A_C_16_A_17 2kpd-m9_A_C_16_A_17 step to class averages
____
____
____
Download Results as
csv or
json file.
Best NtC fitted to input structure. Restraints Restraints file for
REFMAC (steps with RMSD <= 0.5Å)
Commands file for
MMB (steps with RMSD <= 0.5Å)
Restraints file for
Phenix (steps with RMSD <= 0.5Å) [
? ]
User-based restraints REFMAC restraints for of NtCs and refinement output MMB commands for of NtCs and refinement output Phenix restraints for of NtCs [? ] and refinement output Definitions Average
parameters (csv) ,
esd values (csv) , and
Cartesian coordinates of conformers.
Download the papers Description of DNATCO server:
Černý et al., Nucleic Acids Research, 44, W284 (2016). Definition of conformers:
Schneider et al., Acta Cryst D, 74, 52-64 (2018). Example of application:
Schneider et al., Genes, 8(10), 278, (2017).