Similarity of
2gdi_X_GTP_10_G_11 2gdi_X_G_11_A_12 2gdi_X_A_12_C_13 2gdi_X_C_13_U_14 2gdi_X_U_14_C_15 2gdi_X_C_15_G_16 2gdi_X_G_16_G_17 2gdi_X_G_17_G_18 2gdi_X_G_18_G_19 2gdi_X_G_19_U_20 2gdi_X_U_20_G_21 2gdi_X_G_21_C_22 2gdi_X_C_22_C_23 2gdi_X_C_23_C_24 2gdi_X_C_24_U_25 2gdi_X_U_25_U_26 2gdi_X_U_26_C_27 2gdi_X_C_27_U_28 2gdi_X_U_28_G_29 2gdi_X_G_29_C_30 2gdi_X_C_30_G_31 2gdi_X_G_31_U_32 2gdi_X_U_32_G_33 2gdi_X_G_33_A_34 2gdi_X_A_34_A_35 2gdi_X_A_35_G_36 2gdi_X_G_36_G_37 2gdi_X_G_37_C_38 2gdi_X_C_38_U_39 2gdi_X_U_39_G_40 2gdi_X_G_40_A_41 2gdi_X_A_41_G_42 2gdi_X_G_42_A_43 2gdi_X_A_43_A_44 2gdi_X_A_44_A_45 2gdi_X_A_45_U_46 2gdi_X_U_46_A_47 2gdi_X_A_47_C_48 2gdi_X_C_48_C_49 2gdi_X_C_49_C_50 2gdi_X_C_50_G_51 2gdi_X_G_51_U_52 2gdi_X_U_52_A_53 2gdi_X_A_53_U_54 2gdi_X_U_54_C_55 2gdi_X_C_55_A_56 2gdi_X_A_56_C_57 2gdi_X_C_57_C_58 2gdi_X_C_58_U_59 2gdi_X_U_59_G_60 2gdi_X_G_60_A_61 2gdi_X_A_61_U_62 2gdi_X_U_62_C_63 2gdi_X_C_63_U_64 2gdi_X_U_64_G_65 2gdi_X_G_65_G_66 2gdi_X_G_66_A_67 2gdi_X_A_67_U_68 2gdi_X_U_68_A_69 2gdi_X_A_69_A_70 2gdi_X_A_70_U_71 2gdi_X_U_71_G_72 2gdi_X_G_72_C_73 2gdi_X_C_73_C_74 2gdi_X_C_74_A_75 2gdi_X_A_75_G_76 2gdi_X_G_76_C_77 2gdi_X_C_77_G_78 2gdi_X_G_78_U_79 2gdi_X_U_79_A_80 2gdi_X_A_80_G_81 2gdi_X_G_81_G_82 2gdi_X_G_82_G_83 2gdi_X_G_83_A_84 2gdi_X_A_84_A_85 2gdi_X_A_85_G_86 2gdi_X_G_86_U_87 2gdi_X_U_87_U_88 2gdi_X_U_88_CCC_89 2gdi_Y_GTP_10_G_11 2gdi_Y_G_11_A_12 2gdi_Y_A_12_C_13 2gdi_Y_C_13_U_14 2gdi_Y_U_14_C_15 2gdi_Y_C_15_G_16 2gdi_Y_G_16_G_17 2gdi_Y_G_17_G_18 2gdi_Y_G_18_G_19 2gdi_Y_G_19_U_20 2gdi_Y_U_20_G_21 2gdi_Y_G_21_C_22 2gdi_Y_C_22_C_23 2gdi_Y_C_23_C_24 2gdi_Y_C_24_U_25 2gdi_Y_U_25_U_26 2gdi_Y_U_26_C_27 2gdi_Y_C_27_U_28 2gdi_Y_U_28_G_29 2gdi_Y_G_29_C_30 2gdi_Y_C_30_G_31 2gdi_Y_G_31_U_32 2gdi_Y_U_32_G_33 2gdi_Y_G_33_A_34 2gdi_Y_A_34_A_35 2gdi_Y_A_35_G_36 2gdi_Y_G_36_G_37 2gdi_Y_G_37_C_38 2gdi_Y_C_38_U_39 2gdi_Y_U_39_G_40 2gdi_Y_G_40_A_41 2gdi_Y_A_41_G_42 2gdi_Y_G_42_A_43 2gdi_Y_A_43_A_44 2gdi_Y_A_44_A_45 2gdi_Y_A_45_U_46 2gdi_Y_U_46_A_47 2gdi_Y_A_47_C_48 2gdi_Y_C_48_C_49 2gdi_Y_C_49_C_50 2gdi_Y_C_50_G_51 2gdi_Y_G_51_U_52 2gdi_Y_U_52_A_53 2gdi_Y_A_53_U_54 2gdi_Y_U_54_C_55 2gdi_Y_C_55_A_56 2gdi_Y_A_56_C_57 2gdi_Y_C_57_C_58 2gdi_Y_C_58_U_59 2gdi_Y_U_59_G_60 2gdi_Y_G_60_A_61 2gdi_Y_A_61_U_62 2gdi_Y_U_62_C_63 2gdi_Y_C_63_U_64 2gdi_Y_U_64_G_65 2gdi_Y_G_65_G_66 2gdi_Y_G_66_A_67 2gdi_Y_A_67_U_68 2gdi_Y_U_68_A_69 2gdi_Y_A_69_A_70 2gdi_Y_A_70_U_71 2gdi_Y_U_71_G_72 2gdi_Y_G_72_C_73 2gdi_Y_C_73_C_74 2gdi_Y_C_74_A_75 2gdi_Y_A_75_G_76 2gdi_Y_G_76_C_77 2gdi_Y_C_77_G_78 2gdi_Y_G_78_U_79 2gdi_Y_U_79_A_80 2gdi_Y_A_80_G_81 2gdi_Y_G_81_G_82 2gdi_Y_G_82_G_83 2gdi_Y_G_83_A_84 2gdi_Y_A_84_A_85 2gdi_Y_A_85_G_86 2gdi_Y_G_86_U_87 2gdi_Y_U_87_U_88 2gdi_Y_U_88_CCC_89 step to class averages
____
____
____
Download Results as
csv or
json file.
Best NtC fitted to input structure. Restraints Restraints file for
REFMAC (steps with RMSD <= 0.5Å)
Commands file for
MMB (steps with RMSD <= 0.5Å)
Restraints file for
Phenix (steps with RMSD <= 0.5Å) [
? ]
User-based restraints REFMAC restraints for of NtCs and refinement output MMB commands for of NtCs and refinement output Phenix restraints for of NtCs [? ] and refinement output Definitions Average
parameters (csv) ,
esd values (csv) , and
Cartesian coordinates of conformers.
Download the papers Description of DNATCO server:
Černý et al., Nucleic Acids Research, 44, W284 (2016). Definition of conformers:
Schneider et al., Acta Cryst D, 74, 52-64 (2018). Example of application:
Schneider et al., Genes, 8(10), 278, (2017).